Taqman探针法:
在PCR扩增反应加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针(Taqman探针),该探针5’端标记一个荧光染料报告基团(Reporter, R),3’端标记一个淬灭荧光基团(Quencher, Q)。开始时,探针完整地结合在DNA任意一条单链上,报告基团(R)发射的荧光信号被淬灭基团(Q)吸收,检测不到荧光信号;PCR扩增时,Taq酶的核酸外切酶活性将探针酶切降解,使报告基团(R)和淬灭基团(Q)分离,从而发出荧光,切割下来的荧光分子数与PCR产物的数量成正比,可以通过检测PCR反应体系中的荧光强度检测PCR产物的扩增量(如下图所示)。因此,探针的设计尤为关键。
超级淬灭探针(Super Quencher, SQ)
为了有效降低本底荧光信号的干扰,提高检测灵敏度,攻克淬灭剂小分子合成技术难题,百力格自主研发超级淬灭探针(SQ)。除了在3’端标记有独特的淬灭基团,同时在序列中间增加一个淬灭基团(如下图所示),双重淬灭防护,防止荧光泄漏,确保更好的淬灭效果。
优点:
高灵敏度:最低检出下限至1 copy;
高性噪比:有效降低背景荧光信号;
多重qPCR检测:有效避免不同荧光通道窜道问题,减少假阳性。
明星搭配
5’-修饰 | 3’-修饰 | |
6-FAM | SQ-1 | |
VIC/HEX | SQ-1 | |
★ROX | ★SQ-X | |
Cy5 | SQ-2 |
qPCR应用
同一序列不同淬灭基团修饰荧光背景强度比较
FAM-SQ1
非洲猪瘟AsFV-p72基因检测,绿色为FAM-SQ1,红色为FAM-BHQ1。
VIC-SQ1
猴痘质粒检测,(左)50,000以下本底是VIC-SQ1,200,000左右是VIC普通探针;(右)蓝色是VIC-SQ1,绿色是VIC普通探针。
★ROX-SQX★
检测模板依次为105,104,103,102,101 copies/μl的质粒,(左)100,000以下本底的是ROX-SQX,400,000左右的是ROX普通探针;(右)蓝色是ROX-SQX,绿色是ROX普通探针。
Cy5-SQ2
新冠2019-nCov O基因检测,蓝色为BF650-SQ2,红色为Cy5-BHQ2,BF650与Cy5为相同通道。
dPCR应用
左侧为普通Taqman探针,右侧为超级淬灭SQ探针荧光信号检测结果。
FAM通道 | HEX通道 | Cy5通道 |
超级淬灭探针在FAM和Cy5通道,阴性信号均有显著降低;在HEX通道,虽然阴性信号没有影响,但阳性信号强度有所提升,使dPCR微滴信号信噪比(S/N)较普通Taqman探针均有显著提高。另外,三种超级淬灭探针荧光信号在dPCR系统中均无串道和信号衰减。