捕获探针设计

• 设计流程

• 设计优势
  

1.  多种识别方式：bed格式文件，Fasta 文件格式,GeneSymbol等；

2.  优化的算法：综合考虑了探针的GC 平衡、特异性、探针之间的二聚体、发卡结构等。使用更细的颗粒度寻找最佳探针方案,同时确保使用更少的探针达到覆盖度最大化,减少成本；

3.  灵活的参数选择：可选择1x,2xtiling和overiap等不同的密度模式和不同的参考基因组或者目标序列,不仅限于常见模式生物或者人类基因组：根据序列特异性,极端GC以及结构区域对探针风险进行分级等；

4.  多种设计方案：不同区间采用不同的方案,例如:基因区间和间区、SNP骨架、MSI采用不同的优化算法进行设计；

5.  可持续性：通过spike-in 的方式,可以在原有的panel中另外添加探针形成新的panel；

6.  使用灵活、门槛低：smartbaits采用SOL关系型数据库后端,以最小化需要高内存负载和大量V0计算时间的数据文件问题。用户可以快速使用多个不同的筛选标准重新分析,并最小化使用门槛。

• 设计报告

捕获探针设计工具链接：

• 性能测试

1.  百力格SmartBaits设计工具，设计的panel性能优于竞品Ixx设计工具；

2.  竞品Ixx设计的panel基础上，用SmartBaits专用算法对未覆盖的高度重复困难区域设计探针spike-in，提升覆盖度&捕获效率。

• 服务流程

• 服务特点